Estudio de siRNA para la identificación de virus presentes en el banco de germoplasma de Achira (Canna edulis) Ker Gawl. (Cannaceae)

Abstract

En este estudio se analizó el banco de germoplasma de Achira (Canna edulis), una planta tropical utilizada para fines alimenticios y ornamentales en muchos países del mundo, el cual está a cargo de la corporación colombiana de investigación agropecuaria AGROSAVIA, localizado en centro de investigación La Selva (Rionegro - Antioquia) y con copia en centro de investigación Nataima (Espinal - Tolima). El objetivo fue detectar la presencia de virus en las diferentes accesiones de Achira mediante la secuenciación de siARN. Se identificaron virus previamente reportados como el Bean yellow mosaic virus (BYMV- Potyvirus), Canna yellow mosaic virus (CaYMV-Badnavirus) y Canna yellow streak virus (CaYSV-Potyvirus), siendo este último el más predominante y mostrando un porcentaje de identidad de aminoácido menor al 75% con respecto al genoma de referencia. Además, se detectó la posible infección con virus previamente no reportados, como el Lettuce chlorosis virus (LCV-Crinivirus) y Potato yellowing virus (PYV-Ilarvirus). LCV presentó patrones de alto mapeo o Hotspots en las accesiones de las dos localidades en regiones similares, mientras que el PYV solo se detectó en dos muestras en CI La selva. Estos hallazgos son importantes para la conservación y manejo de la variabilidad genética de la Achira y para la implementación de estrategias de control y prevención de la propagación de virus en las poblaciones.